颗核弹炸成了灰。尸骨无存却好端端的重新出场，如果是这样的话，那只有一种可能：“她们是被唤醒的本体。”

“没错。”红皇后的全息影像迟迟出现：“之前在上层蜂巢的公司高管和科研人员都是克隆体。本体早就进入了冷冻休眠状态。先是上层蜂巢被核弹炸毁，深层蜂巢的冷冻休眠区也被爱丽丝（本体）安置的定时炸弹炸毁。你看到的都是两次浩劫的幸存者。”

类似的设定也有先例。在历代记中多次出场的亚历山大·艾萨克斯博士，就是被保护伞公司反复创造的克隆体。

所以这里有一个隐藏的背景设定。就像是在《生化危机3：灭绝》中出场的幕后主使亚历山大·艾萨克斯博士以及在《生化危机6：终章》最先出场的亚历山大·艾萨克斯博士，都是拷贝了本体记忆和能力的克隆体。以此类推，在《生化危机1：变种生还》中死亡的重要的研究人员，尤其是顶尖的博士们，显然也都是各自的克隆体。本体和亚历山大·艾萨克斯博士一样，都静静的沉睡在深层蜂巢内，等待生化启示录后重返地面。为建立一个完美的人类新文明添砖加瓦，一展长才。

“本体休眠，克隆体打工”也符合保护伞一贯的作风。